顺利通关二周目，阵容搭配是关键。二周目的敌人等级更高，属性更复杂，单靠一两只强力宝可梦很难应对所有挑战。建议优先考虑属性平衡和专精搭配，确保队伍能覆盖多种战斗场景。坦克型、输出型、辅助型宝可梦都要合理分配，比如妙蛙花、喷火龙、水箭龟这类初始宝可梦进化后表现稳定，而电击兽、暴鲤龙等能补充队伍短板。
初始宝可梦的选择会影响后期阵容的构建。小火龙进化成喷火龙后拥有火和飞行双属性，打击面广；杰尼龟最终形态水箭龟防御出色，适合持久战；妙蛙花的草和毒属性组合在对抗水系和地面系时优势明显。如果前期选了小火龙，后期可以补充水箭龟或暴鲤龙来平衡属性。电系宝可梦如雷丘或闪电鸟速度快、爆发强，对付水系和飞行系敌人非常有效。
二周目的战斗更考验策略，速度优势和技能搭配很重要。高速宝可梦能先手压制，比如雷丘或化石翼龙；坦克型如大钢蛇能吸收伤害，为队友创造机会。技能选择上尽量多样化，比如妙蛙花的睡眠粉能控场，暴鲤龙的龙舞能强化输出。别忘了带一些恢复类技能或道具，持久战中对续航很有帮助。
后期可以适当加入传说宝可梦提升阵容强度。急冻鸟的冰属性对付龙系效果拔群，超梦的特攻能力几乎无解。不过传说宝可梦不是必需品，普通宝可梦只要培养得当一样能通关。重点是保持队伍等级均衡，避免出现明显短板。多利用属性克制，灵活调整出战顺序，二周目的挑战就会轻松很多。
阵容没有绝对的最优解，根据自己的喜好和战斗风格调整更重要。如果遇到卡关，不妨回顾一下队伍属性是否被克制，或者技能搭配是否合理。耐心培养和合理规划才是通关的核心秘诀。
